нет, когда ты открываешь вторую инстанцию фруктов, в ней ты можешь открыть второй проект. точка. два проекта в одном фрутилупсе не открыть.

чтобы перенести плагины и их настройки с одного канала на другой, нужно просто сохранить статусы. функция save track в миксере. а потом загрузить их в нужном канале.