Группа 1

Сеяные: «Атлетико» (Испания), «Панатинаикос» (Греция), «Бешикташ» (Турция), «Металлист» (Украина), «Партизан» (Сербия)

Несеяные: «Сошо» (Франция), «Витория Гимараэш» (Португалия), «Алания» (Россия), «Маккаби» (Тель-Авив, Израиль), «Шэмрок Роверс» (Ирландия)

Группа 2

Сеяные: «Рома» (Италия), ПСЖ (Франция), «Андерлехт» (Бельгия), «Динамо» (Бухарест, Румыния), «Русенборг» (Норвегия)

Несеяные: «Бурсаспор» (Турция), «Ворскла» (Украина), «Олимпиакос» (Волос, Греция), «Слован» (Словакия), АЕК (Кипр).

Группа 3

Сеяные: «Тоттенхэм» (Англия), «Спартак» (Россия), «Хапоэль» (Тель-Авив, Израиль), «Атлетик» (Испания), ПАОК (Греция)

Несеяные: «Трабзонспор» (Турция), «Карпаты» (Украина), «Хартс» (Шотландия), «Легия» (Польша), «Экранас» (Литва)

Группа 4

Сеяные: «Спортинг» (Португалия), «Рейнджерс» (Шотландия), «Фулхэм» (Англия), «Стяуа» (Румыния), «Локомотив» (Россия)

Несеяные: «Днепр» (Украина), ЦСКА (София, Болгария), «Норселлан» (Дания), «Марибор» (Словения), «Спартак» (Словакия)

Группа 5

Сеяные: ПСВ (Голландия), «Динамо» (Киев, Украина), «Селтик» (Шотландия), «Лацио» (Италия), «Бирмингем» (Англия), «Рапид» (Румыния)

Несеяные: «Насьонал» (Португалия), «Сьон» (Швейцария), «Литекс» (Болгария), «Рид» (Австрия), «Работнички» (Македония), «Сленск» (Польша)

Группа 6

Сеяные: «Севилья» (Испания), «АЗ Алкмар» (Голландия), «Брюгге» (Бельгия), «Спарта» (Чехия), «Зальцбург» (Австрия), «Сток Сити» (Англия)

Несеяные: «Ганновер-96» (Германия), «Васлуй» (Румыния), «Омония» (Кипр), «Тун» (Швейцария), «Олесунн» (Норвегия), «Зестафони» (Грузия)

Группа 7

Сеяные: «Брага» (Португалия), «Шальке» (Германия), «Стандард» (Бельгия), АЕК (Греция), «Ренн» (Франция), «Аустрия» (Австрия)

Несеяные: «Янг Бойз» (Швейцария), «Хельсинборг» (Швеция), «Црвена Звезда» (Сербия), «Газ Метан» (Румыния), ХИК (Финляндия), «Динамо» (Тбилиси, Грузия)