Возможностью логина с нескольких устройств, следовательно и адекватная синхронизация истории между устройствами там есть (за исключением секретных чатов).
Достаточно защищенные те самые секретные чаты. Нет жесткой привязки клиента к устройству, как у WhatsApp. Есть полноценная версия десктопного приложения на QT. Telegram офигенен наличием различных ботов и новостных каналов, реализацией конференций и даже переписываться с людьми там можно не добавляя их себе в контакты на телефоне. Официальный клиент Telegram полностью открытый и свободный. Любой может посмотреть его исходные коды. Закрыта только серверная часть. Потом уже всякие плюшки дополнительные вроде модных стикеров и прочее. Для кого-то это важно. Короче, де-факто WhatsApp ничем не лучше Telegram. Вот, прям совсем при совсем ничем. Просто он появился раньше и стал популярнее. Люди им пользуются, другие его устанавливают для общения с этими людьми, ведь часто бывает так, что установит себе Telegram на мобилку человек, а из списка его контактов у него нет там знакомых, но в WhatsApp есть. Он просто и забивает болт на Telegram, пользуется WhatsApp и всё.