Если вообще, то у Линуха побольше возможностей и поддержки разного оборудования в сравнении с виндой. Все в мире суперкомпьютеры работают на Linux, крутые эффекты для фильмов делают на Linux, в том числе. Например, эффекты для фильма Аватар делали на RadHat Enterprise Linux. А вот российский православный со скрепами процессор Эльбрус на собственной архитектуре поддерживает винда? Конечно, нет. Зато Линух научили поддерживать некоторые дистрибутивы российские. Но это уже преимущество свободного софта над закрытым в целом. Не надо заново изобретать свое колесо, чтобы построить телегу. Берешь готовое и переделываешь как надо под свои нужды.