Если сохраняеш в мп3 - так и будет, т.к. это кодек сам эти паузы вставляет. В wav таких проблем нет. есть еще внутренний формат *.cel Он на том же мп3 кодеке тока паузы не добавляет, правда кроме как в аудишене его ничем не открыть.