Есть нескоторые программы проверки,которые работают в Live режиме.
например,Нортон Утилиты(если я не ошибаюсь,ибо давно их не юзал).
Ты можешь загрузить прогу с ЦД и прошуршать ею диск.
И ясный хуй,что это будет долго.