Я особо не парился над этим, но обычно делаю так - после сведения, выбираешь "Save Complete Vip In" в меню File , создаешь новую папку и в неё сохраняешь. В этом случае, в этой же папке вместе с проектом сохранятся только заюзанные в проекте аудиофайлы.